本教材的体系与结构力求突出家畜育种工作的重点与主要环节，基于此安排了九篇共二十三章。九篇分别为：育种对象；生长发育规律；选种；交配系统；杂种优势利用；新品系与新品种的培育；育种新技术；地方畜禽遗传资源；育种工作的组织。二十三章分别为：品种；性状；家畜生长发育规律；选择的作用；数量性状选择的效果与方法；种畜生产性能测定；种畜遗传评估（一）：单性状育种值估计；种畜遗传评估（二）：多性状育种值估计——选择指数；种畜遗传评估（三）：BLUP育种值估计；质量性状与阈性状的选择；近交；品质选配；种群选配——杂交繁育与纯繁；杂种优势的表现规律及其在商品畜禽生产中的利用；配套系培育及其利用；新品系培育；新品种培育；胚胎生物技术与育种；转基因动物技术与育种；分子育种；地方畜禽遗传资源的评估；地方畜禽遗传资源的保护；我国家畜育种工作的组织。